Construite en 1876, elle est à l’origine une gare de passage entre Saujon et le débarcadère du bac de la Grève. Elle est gérée par la Compagnie du Chemin de Fer de la Seudre jusqu’en 1880 puis passe sous le contrôle des Chemins de fer de l’État. Elle devient réservée en 1939 au trafic sur rail de marchandises, notamment des huîtres depuis La Tremblade et les autres gares de la Seudre.

En 1978, la section entre cette gare et le terminus de La Grève est déclassée et elle devient le terminus de la ligne touristique du "Train des Mouettes".

Les travaux de réhabilitation de l’ancienne gare en locaux affectés aux services du port débutent en septembre 2021 (durée prévisionnelle : 14 mois).