Mentionnés pour la première fois au 15^e siècle, le manoir et son domaine appartiennent alors à Jean de Châteaubardon. Est lié à ce domaine le droit de nommer un prévôt pour la baronnie de Didonne. Passé de main en main, Château-Bardon est cédé en 1595 à Gilles du Breuil, seigneur de Théon‑de‑Meschers, issus de la famille de Théon d’Arces‑sur‑Gironde : le domaine reste propriété de sa descendance jusqu’au 19^e siècle.
Meschers-sur-Gironde étant une place de conflits entre troupes royalistes et protestants, le château est saccagé en 1915. Reconstruit, la partie la plus ancienne du manoir date du 17^e siècle.

Source(s) : Inventaire du Patrimoine Poitou-Charente.